現時点の最新のEmotetの感染有無の確認は、プロセス一覧の中にrundll32.exeが動いており、その引数のファイルの拡張子がdllでない、実行のエクスポート関数がRunDLLである、ということ、それがレジストリRunキーに設定されている、という点を確認する必要があると思われます。
ただ、これはすぐに変更可能な点ですので、確認ポイントとして今後しばらく使えるか、という点は不明です。